原核生物和真核生物在识别起始密码子AUG时采用不同的机制。在原核生物中，核糖体小亚基中的16SrRNA的3'端序列与mRNA5'端的Shine-Dalgarno（SD）序列通过互补配对结合，随后以SD序列下游的第一个AUG作为起始密码子。而在真核生物中，核糖体小亚基首先与mRNA5'端的帽子结构结合，然后沿mRNA向下游移动，直到遇到第一个合适的AUG作为起始密码子。这两种机制分别适应了原核和真核生物在翻译起始过程中的不同需求。