南京中医药大学创建于1954年，是国家“双一流”建设高校、江苏高水平大学建设高校（A类），教育部、江苏省人民政府与国家中医药管理局共建高校。学校是全国建校最早的高等中医药院校之一，为新中国高等中医药教育培养输送了第一批师资、编撰了第一套教材、制订了第一版教学大纲，为新中国高等中医药教育模式的确立和推广作出了开创性贡献，被誉为“高等中医教育的摇篮”。
学校坚持中医药为主体、中西医结合、多学科交叉协调发展，秉承“学贯中西，至精至诚”的办学理念，坚持传承精华、守正创新。学校现有国家“双一流”建设学科1个，国家重点学科3个，国家重点（培育）学科2个，江苏高校优势学科4个，“十四五”省重点学科8个，国家中医药管理局中医药重点学科33个。学校是全国首批博士学位、硕士学位授予单位，有4个一级学科博士学位授权点、1个博士专业学位授权点、12个一级学科硕士学位授权点及6个硕士专业学位授权点，3个博士后科研流动站。
南京中医药大学博士点
| 医学 | ||
| 中医基础理论[100501] | 中医五官科学[100511] | 中药化学与分析[1008Z5] |
| 中医临床基础[100502] | 针灸推拿学[100512] | 中医内科学[105118] |
| 中医医史文献[100503] | 中医康复学[1005Z1] | 中医妇科学[105121] |
| 方剂学[100504] | 中西医结合基础[100601] | 中医儿科学[105122] |
| 中医诊断学[100505] | 中西医结合临床[100602] | 中医五官科学[105123] |
| 中医内科学[100506] | 中药学[100800] | 针灸推拿学[105124] |
| 中医外科学[100507] | 中药炮制学[1008Z1] | 中西医结合临床[105126] |
| 中医骨伤科学[100508] | 中药药理学[1008Z2] | 护理学[101100] |
| 中医妇科学[100509] | 中药药剂学[1008Z3] | |
| 中医儿科学[100510] | 中药资源与鉴定[1008Z4] | |
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