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南京信息工程大学是国家“双一流”建设高校，是江苏高水平大学建设高峰计划A类建设高校。
学校办学特色鲜明，大气科学入选国家“世界一流学科”建设学科，在教育部最新学科评估中取得优异成绩。气象学为国家重点学科，地球科学、工程学、计算机科学、环境科学与生态学、化学、农业科学、材料科学、社会科学总论、数学等9个学科跻身ESI学科排名全球前1%，其中地球科学和计算机科学进入ESI全球排名前1‰。拥有大气科学、环境科学与工程、信息与通信工程、管理科学与工程、数学、科学技术史、计算机科学与技术7个一级学科博士学位授权点，25个一级学科硕士学位授权点、19个硕士专业学位授权点。学校现有“大气科学”“环境科学与工程”“数学”“管理科学与工程”博士后科研流动站，80个本科专业分布于理、工、文、管、经、法、农、艺、教9个学科领域。
南京信息工程大学博士点
| 博士交叉学科 | ||
| 人工智能[99J2] | 遥感信息科学与技术[99J3] | 应急管理[99J1] |
| 工学 | ||
| 生物环境信息材料[0830Z3] | 信息安全[0810Z2] | 环境生态学[0830Z2] |
| 环境科学与工程[083000] | 导航与空间信息[0810Z3] | 计算机科学与技术[081200] |
| 信息与通信工程[081000] | 环境感知与智能控制[0810Z4] | |
| 光电信息工程[0810Z1] | 环境遥感[0830Z1] | |
| 理学 | ||
| 气象学[070601] | 雷电科学与技术[0706Z4] | 数学[070100] |
| 大气物理学与大气环境[070602] | 3S集成与气象应用[0706Z5] | 科学技术史[071200] |
| 气候系统与气候变化[0706Z1] | 空间天气学[0706Z6] | 地表圈层与过程[0706Z8] |
| 应用气象学[0706Z2] | 海洋气象学[0706Z7] | |
| 大气遥感与大气探测[0706Z3] | 水文气象学[0706Z9] | |
| 管理学 | ||
| 管理科学与工程[120100] | 高等教育管理[1201Z1] | 大数据与商务智能[1201Z2] |
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