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海军军医大学是一所培养卫生事业专门人才的全国重点医科大学。
学校现为国家“双一流”重点学科建设院校、国家“211工程”重点建设院校，是36个“国家生命科学与技术人才培养基地”之一。我校设有全国唯一的中医学八年制专业，现有的海军医学系、卫生勤务学系、中医系、麻醉系均为全军唯一的专业系。学校一级国家重点学科数2个，二、三级国家重点学科数26个；现有硕士学位授权点93个、博士学位授权点83个、博士后流动站7个。
海军军医大学博士点
| 医学 | ||
| 人体解剖与组织胚胎学[100101] | 临床遗传学[1002J2] | 海军航空医学[1009Z2] |
| 免疫学[100102] | 血管病学[1002Z1] | 成人护理学[1011Z1] |
| 病原生物学[100103] | 输血医学[1002Z2] | 社区护理学[1011Z4] |
| 病理学与病理生理学[100104] | 医学心理学[1002Z3] | 精神与心理卫生护理学[1011Z6] |
| 放射医学[100106] | 流行病与卫生统计学[100401] | 护理教育与护理管理学[1011Z7] |
| 内科学[100201] | 劳动卫生与环境卫生学[100402] | 内科学[105101] |
| 儿科学[100202] | 营养与食品卫生学[100403] | 老年医学[105103] |
| 老年医学[100203] | 卫生毒理学[100405] | 神经病学[105104] |
| 神经病学[100204] | 军事预防医学[100406] | 皮肤病与性病学[105106] |
| 精神病与精神卫生学[100205] | 中西医结合临床[100602] | 影像医学与核医学[105107] |
| 皮肤病与性病学[100206] | 药物化学[100701] | 临床检验诊断学[105108] |
| 影像医学与核医学[100207] | 药剂学[100702] | 外科学[105109] |
| 临床检验诊断学[100208] | 生药学[100703] | 妇产科学[105110] |
| 外科学[100210] | 药物分析学[100704] | 眼科学[105111] |
| 妇产科学[100211] | 微生物与生化药学[100705] | 耳鼻咽喉科学[105112] |
| 眼科学[100212] | 药理学[100706] | 肿瘤学[105113] |
| 耳鼻咽喉科学[100213] | 临床药学[1007Z1] | 麻醉学[105116] |
| 肿瘤学[100214] | 社会与管理药学[1007Z3] | 急诊医学[105117] |
| 麻醉学[100217] | 中药资源学[1008Z1] | 中西医结合临床[105126] |
| 急诊医学[100218] | 中药鉴定学[1008Z2] | 社会医学与卫生事业管理[107401] |
| 再生医学[1002J1] | 航海与潜水医学[1009Z1] | |
| 理学 | ||
| 生理学[071003] | 遗传学[071007] | 生物物理学[071011] |
| 微生物学[071005] | 细胞生物学[071009] | 军事生物工程[0710Z1] |
| 神经生物学[071006] | 生物化学与分子生物学[071010] | 海洋生物技术[0710Z2] |
| 管理学 | ||
| 社会医学与卫生事业管理[120402] | ||
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