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| 院校名称 | 主管部门 | 所在城市 | 博士学位授予类型 | 备注 |
| 北京大学 | 教育部 | 北京市 | 博士学术学位 | 985 |
| 清华大学 | 教育部 | 北京市 | 博士学术学位 | 985 |
| 中国人民大学 | 教育部 | 北京市 | 博士学术学位 | 985 |
| 中国农业大学 | 教育部 | 北京市 | 博士学术学位 | 985 |
| 北京师范大学 | 教育部 | 北京市 | 博士学术学位 | 985 |
| 北京航空航天大学 | 工信部 | 北京市 | 博士学术学位 | 985 |
| 北京理工大学 | 工信部 | 北京市 | 博士学术学位 | 985 |
| 中央民族大学 | 国家民委 | 北京市 | 博士学术学位 | 985 |
| 北京科技大学 | 教育部 | 北京市 | 博士学术学位 | 211 |
| 北京交通大学 | 教育部 | 北京市 | 博士学术学位 | 211 |
| 北京化工大学 | 教育部 | 北京市 | 博士学术学位 | 211 |
| 北京邮电大学 | 教育部 | 北京市 | 博士学术学位 | 211 |
| 北京林业大学 | 教育部 | 北京市 | 博士学术学位 | 211 |
| 北京中医药大学 | 教育部 | 北京市 | 博士学术学位 | 211 |
| 北京外国语大学 | 教育部 | 北京市 | 博士学术学位 | 211 |
| 中国传媒大学 | 教育部 | 北京市 | 博士学术学位 | 211 |
| 中央财经大学 | 教育部 | 北京市 | 博士学术学位 | 211 |
| 对外经济贸易大学 | 教育部 | 北京市 | 博士学术学位 | 211 |
| 中国政法大学 | 教育部 | 北京市 | 博士学术学位 | 211 |
| 华北电力大学 | 教育部 | 北京市 | 博士学术学位 | 211 |
| 中国矿业大学(北京) | 教育部 | 北京市 | 博士学术学位 | 211 |
| 中国石油大学(北京) | 教育部 | 北京市 | 博士学术学位 | 211 |
| 中国地质大学(北京) | 教育部 | 北京市 | 博士学术学位 | 211 |
| 中国科学院大学 | 中国科学院 | 北京市 | 博士学术学位 | 双一流 |
| 中国社会科学院大学 | 中国社会科学院 | 北京市 | 博士学术学位 | |
| 北京体育大学 | 国家体育总局 | 北京市 | 博士学术学位 | 211 |
| 中央音乐学院 | 教育部 | 北京市 | 博士学术学位 | 211 |
| 中央美术学院 | 教育部 | 北京市 | 博士学术学位 | 双一流 |
| 中央戏剧学院 | 教育部 | 北京市 | 博士学术学位 | 双一流 |
| 中国人民公安大学 | 公安部 | 北京市 | 博士学术学位 | 211 |
| 北京协和医学院 | 国家卫健委 | 北京市 | 博士学术学位 | 双一流 |
| 外交学院 | 外交部 | 北京市 | 博士学术学位 | 双一流 |
| 北京语言大学 | 教育部 | 北京市 | 博士学术学位 | |
| 国际关系学院 | 教育部 | 北京市 | 博士学术学位 | |
| 北京电子科技学院 | 中央办公厅 | 北京市 | 博士学术学位 | |
| 北京工业大学 | 北京市 | 北京市 | 博士学术学位 | 211 |
| 首都师范大学 | 北京市 | 北京市 | 博士学术学位 | 双一流 |
| 首都医科大学 | 北京市 | 北京市 | 博士学术学位 | |
| 首都经济贸易大学 | 北京市 | 北京市 | 博士学术学位 | |
| 北京工商大学 | 北京市 | 北京市 | 博士学术学位 | |
| 北京建筑大学 | 北京市 | 北京市 | 博士学术学位 | |
| 北京信息科技大学 | 北京市 | 北京市 | 博士学术学位 | |
| 中国音乐学院 | 北京市 | 北京市 | 博士学术学位 | |
| 北京电影学院 | 北京市 | 北京市 | 博士学术学位 | |
| 北方工业大学 | 北京市 | 北京市 | 特殊需求博士 | |
| 北京服装学院 | 北京市 | 北京市 | 特殊需求博士 | |
| 首都体育学院 | 北京市 | 北京市 | 特殊需求博士 |
